В те времена, когда работал Шарль Мессье, телескопы были ещё не очень совершенны. Но кометы с их помощью уже искали. Однако на небе до фига разных объектов, которые выглядя почти как кометы - но кометами не являются. Это всякие туманности - другие галактики, звёздные скопления, газовые и пылевые туманности... Вот для того, чтоб астрономы, обнаружив новый туманный объект, могли отнести его к кометам и не открывать заново нечто уже известное, месье Мессье и создал свой каталог туманностей. Не вообще всех объектов, а - объектов только одного класса.
Входящие в него объекты обычно обозначаются буквой М и числом - порядковым номером туманности в каталоге Мессье. Например. Туманность Андромеды - это М31, Крабовидная туманность - М1, ну и так далее..