Главным неудобством двухэтажных купейных вагонов является практическое отсутствие места для ручной клади, особенно для пассажиров верхней полки второго этажа. Тем, кто берет билет на такие места, вообще не стоит брать вещей больше, чем небольшая сумочка, которую можно разместить на полке рядом с собой, положив под подушку. Либо договариваться с пассажиром с нижней полки, чтобы поделить с ним пространство под нижней полкой, которое там также не слишком большое. Впрочем, идея, что пассажир верхней полки -- это существо второго сорта, права и жизненное пространство которого можно ограничивать по полной программе, прочно обосновалась в мозгах РЖД-чиновников. В новых плацкартных вагонах также впору вводить ограничения по ручной клади для "верхних", как на самолетах "Победы": рюкзак или чемодан обычных размеров на верхней багажной полке там не разместишь, не говоря уж о том, чтобы везти с собой, к примеру, гитару. В старых плацкартных и купейных вагонах не возникало никаких проблем с размещением багажа, когда в одном купе ехали четыре туриста-КСПшника, у каждого из которых -- большой рюкзак и гитара.
Вместе с тем, сидячие двухэтажные вагоны, как в поезде Москва-Воронеж -- очень удобны, независимо от того, на каком этаже ехать. Одноэтажные сидячие вагоны, за вагонов от расформированного поезда "Юность", которые иногда встречаются в таких составах, менее удобны. И хотя и здесь есть проблемы с провозом гитары (проблемы "стерические", а не юридические -- ограничений и требований выкупать второе место для инструмента пока что не появилось), они не столь жесткие, как в новых плацкартных и двухэтажных купейных вагонах.
У купейного двухэтажного вагона есть и некоторый психологический источник дискомфорта для тех, кто страдает клаустрофобией. На втором этаже пространство между полкой и потолком купе очень маленькое, и хотя проблем поместиться в него нет, кого-то это может напрягать.
